Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Plod3Q9R0E1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Plod3Q9R0E1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms