Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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Gpc1Q9QZF2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gpc1Q9QZF2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Gpc1Q9QZF2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Gpc1Q9QZF2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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Gpc1Q9QZF2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Gpc1Q9QZF2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Gpc1Q9QZF2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gpc1Q9QZF2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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