Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sh3glb1Q9JK48 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3glb1Q9JK48 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms