Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sh3bgrlQ9JJU8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sh3bgrlQ9JJU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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