Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ccl28Q9JIL2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl28Q9JIL2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms