Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn19Q9ET38 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn19Q9ET38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms