Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snap29Q9ERB0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snap29Q9ERB0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms