Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx6Q9ER75 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx6Q9ER75 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx6Q9ER75 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms