Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Stx12Q9ER00 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Stx12Q9ER00 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms