Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SgshQ9EQ08 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SgshQ9EQ08 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms