Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr1Q9EPQ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tlr1Q9EPQ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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