Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc46a3Q9DC26 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc46a3Q9DC26 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms