Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SrpraQ9DBG7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SrpraQ9DBG7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms