Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt34Q9D646 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt34Q9D646 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms