Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smim3Q99PE5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms