Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tsnaxip1Q99P25 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Tsnaxip1Q99P25 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms