Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a6bQ99N09 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a6bQ99N09 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms