Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gps1Q99LD4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gps1Q99LD4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms