Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TriobpQ99KW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TriobpQ99KW3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TriobpQ99KW3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms