Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlgn1Q99K10 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlgn1Q99K10 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlgn1Q99K10 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms