Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Snx15Q91WE1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Snx15Q91WE1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms