Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fam20bQ8VCS3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fam20bQ8VCS3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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