Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrit1Q8K099 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Lrit1Q8K099 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrit1Q8K099 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms