Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E4f1Q8CCE9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
E4f1Q8CCE9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
E4f1Q8CCE9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms