Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sec22cQ8BXT9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec22cQ8BXT9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8614.1 ms