Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem260Q8BMD6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tmem260Q8BMD6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem260Q8BMD6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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