Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atg4dQ8BGV9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg4dQ8BGV9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg4dQ8BGV9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms