Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtn4rl2Q7M6Z0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtn4rl2Q7M6Z0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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