Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot1Q6ZQ08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cnot1Q6ZQ08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms