Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2surpQ6NV83 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
U2surpQ6NV83 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
U2surpQ6NV83 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms