Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zic3Q62521 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zic3Q62521 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms