Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxd1Q61345 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd1Q61345 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms