Protein–RNA interactions for Protein: Q571F5

Spsb3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb3Q571F5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spsb3Q571F5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spsb3Q571F5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms