Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930567H17RikQ3V0K5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms