Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nkain3Q3URJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nkain3Q3URJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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