Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1V6

Uevld, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UevldQ3U1V6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UevldQ3U1V6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
UevldQ3U1V6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms