Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdkn1bP46414 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms