Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tacr1P30548 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms