Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Casp1P29452 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp1P29452 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp1P29452 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp1P29452 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp1P29452 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp1P29452 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms