Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kif3aP28741 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kif3aP28741 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms