Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psmb9P28076 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psmb9P28076 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms