Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpm3P21107 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tpm3P21107 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms