Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxb3P09026 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxb3P09026 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms