Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc4a4O88343 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms