Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dkk1O54908 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dkk1O54908 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dkk1O54908 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dkk1O54908 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dkk1O54908 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms