Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-ObO35424 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2-ObO35424 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms