Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad7O35253 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad7O35253 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms