Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cdh18E9Q9Q6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Cdh18E9Q9Q6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cdh18E9Q9Q6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cdh18E9Q9Q6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms