Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Brpf1B2RRD7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Brpf1B2RRD7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Brpf1B2RRD7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms