Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Col9a3A2ACT7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Col9a3A2ACT7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Col9a3A2ACT7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms